在名为星元市的小城市上，狮子尾山上耸立着一个闪耀着彩色光芒的巨大物体——“摩诺之角”，这是16年前“怪兽之日”事件后留下的“怪兽的角”。全球怪兽灾害变成了日常，日本地球防卫队以武力对抗怪兽，而怪兽防灾科学调查所（简称SKIP）则在世界各地进行科学调查和避难引导，探索“怪兽之日”的秘密。7岁的优马在狮子尾山遭遇怪兽袭击奇迹生还，激发了他对怪兽生物学的兴趣。依靠“想象的力量”，他成为新手调查员，被派往星元市分所。正当他面对城市的怪兽灾害时，“卢提昂”光之使者出现在他心中，启示他释放想象力。